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Accounting for the indirect area effect in stacked species distribution models to map species richness in a montane biodiversity hotspot / Robin Pouteau in Diversity and Distributions, 21(11) (2015) 

Public ISBD [article]  in Diversity and Distributions > 21(11) (2015) . - 329-1338 Titre : Accounting for the indirect area effect in stacked species distribution models to map species richness in a montane biodiversity hotspot Type de document : article Auteurs : Robin Pouteau ; Elise Bayle ; Elodie Blanchard ; Philippe Birnbaum ; Jean-Jérôme Cassan ; Vanessa Hequet ; Thomas Ibanez ; Hervé Vandrot Année de publication : 2015 Article en page(s) : 329-1338 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Alpha diversity  biodiversity mapping  gamma diversity  herbarium data  mountain ecology  tropical rain forest Résumé : Aim: Understanding how species richness is distributed is a critical prerequisite to implement efficient conservation strategies in biodiversity hotspots. Stacked species distribution models (S-SDMs) provide new opportunities to map species richness, but the accuracy of this method may decline with elevation. Here, we test whether variation in model accuracy arises from increasingly unpredictable environments or the decreasing availability of area with increasing elevation, which might affect the regional pool of species and, as a result, the local species richness (the indirect area effect). Location: The New Caledonian biodiversity hotspot (south-west Pacific Ocean). Methods: An individual MAXENT model was built for 562 tree species by combining eight 100-m resolution environmental variables with c. 10,000 occurrence records. For each species, a map was produced at a one-hectare scale indicating the estimated habitat suitability. All models were then summed, and the resulting estimates were compared with richness measured in 11 independent one-hectare inventories. To account for the indirect area effect, S-SDM estimates were adjusted through the Arrhenius' equation linking the number of species hosted by a habitat with its surface area. Results: The S-SDM predictions ranged from 95 to 251 species (mean = 153) while field inventories were lower, ranging from 39 to 131 species (mean = 90). Overall, the S-SDM increasingly overestimated richness as elevation increased. Taking into account the indirect area effect de-correlated residuals from elevation and induced a significant correlation between modelled and measured species richness. Conclusion: The decreasing accuracy of the S-SDM with elevation was explained by the decreasing availability of habitat influencing regional diversity found in each elevational band. Despite remaining difficulties to predict species richness when addressing the indirect area effect, our findings represent a significant step forward towards improved S-SDM designing. Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Fonds documentaire : IAC En ligne : http://onlinelibrary.wiley.com.proxy.univ-nc.nc/doi/10.1111/ddi.12374/abstract [article] Accounting for the indirect area effect in stacked species distribution models to map species richness in a montane biodiversity hotspot [article] / Robin Pouteau ; Elise Bayle ; Elodie Blanchard ; Philippe Birnbaum ; Jean-Jérôme Cassan ; Vanessa Hequet ; Thomas Ibanez ; Hervé Vandrot . - 2015 . - 329-1338. Langues : Anglais (eng) in Diversity and Distributions > 21(11) (2015) . - 329-1338 Mots-clés : Alpha diversity  biodiversity mapping  gamma diversity  herbarium data  mountain ecology  tropical rain forest Résumé : Aim: Understanding how species richness is distributed is a critical prerequisite to implement efficient conservation strategies in biodiversity hotspots. Stacked species distribution models (S-SDMs) provide new opportunities to map species richness, but the accuracy of this method may decline with elevation. Here, we test whether variation in model accuracy arises from increasingly unpredictable environments or the decreasing availability of area with increasing elevation, which might affect the regional pool of species and, as a result, the local species richness (the indirect area effect). Location: The New Caledonian biodiversity hotspot (south-west Pacific Ocean). Methods: An individual MAXENT model was built for 562 tree species by combining eight 100-m resolution environmental variables with c. 10,000 occurrence records. For each species, a map was produced at a one-hectare scale indicating the estimated habitat suitability. All models were then summed, and the resulting estimates were compared with richness measured in 11 independent one-hectare inventories. To account for the indirect area effect, S-SDM estimates were adjusted through the Arrhenius' equation linking the number of species hosted by a habitat with its surface area. Results: The S-SDM predictions ranged from 95 to 251 species (mean = 153) while field inventories were lower, ranging from 39 to 131 species (mean = 90). Overall, the S-SDM increasingly overestimated richness as elevation increased. Taking into account the indirect area effect de-correlated residuals from elevation and induced a significant correlation between modelled and measured species richness. Conclusion: The decreasing accuracy of the S-SDM with elevation was explained by the decreasing availability of habitat influencing regional diversity found in each elevational band. Despite remaining difficulties to predict species richness when addressing the indirect area effect, our findings represent a significant step forward towards improved S-SDM designing. Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Fonds documentaire : IAC En ligne : http://onlinelibrary.wiley.com.proxy.univ-nc.nc/doi/10.1111/ddi.12374/abstract

Caractérisation des connectivités structurelle et fonctionnelle des paysages fragmentés sur sols ultramafiques / Philippe Birnbaum

Public ISBD Titre : Caractérisation des connectivités structurelle et fonctionnelle des paysages fragmentés sur sols ultramafiques : Projet CoRiFor Type de document : rapport Auteurs : Philippe Birnbaum ; Morgan Mangeas ; Laurent Maggia ; P Marmey ; Marc Despinoy ; Céline Gomez ; Vanessa Hequet ; Thomas Ibanez ; Hervé Vandrot ; Elodie Blanchard ; Géraldine Bidau Editeur : CNRT/Nickel et son environnement Année de publication : 2015 Autre Editeur : IAC Edition Importance : 28p. Mots-clés : télédétection Résumé : L’objectif principal du projet CoRiFor est de déterminer dans quelle mesure la fragmentation actuelle des paysages agit sur la connectivité écologique en évaluant les relations liant la composition (floristique et biologique) des peuplements forestiers avec la structure (superficie et distance inter-isolat) d’un environnement forestier fragmenté. La démarche retenue consiste à confronter 1) les composantes des peuplements au travers des espèces les plus communes et de leur capacité de dispersion avec 2) les caractéristiques structurales du paysage fragmenté mesuré sur une grande superficie par les méthodes de la télédétection. Par ailleurs, cette approche permettra d’analyser la connectivité au travers de deux échelles principales qui sont 1) le paysage ou peuplement par le biais des inventaires floristiques et de la caractérisation des paramètres structuraux et 2) le fonctionnement des organismes par le biais de la mesure et de l’estimation des capacités de dispersion et d’adaptation aux conditions écologiques Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Rapport : Appel à projet/Intermédiaire N° rapport : N°2(2014) Convention/Partenariat : CNRT/IAC/CIRAD/IRD Fonds documentaire : IAC Caractérisation des connectivités structurelle et fonctionnelle des paysages fragmentés sur sols ultramafiques : Projet CoRiFor [rapport] / Philippe Birnbaum ; Morgan Mangeas ; Laurent Maggia ; P Marmey ; Marc Despinoy ; Céline Gomez ; Vanessa Hequet ; Thomas Ibanez ; Hervé Vandrot ; Elodie Blanchard ; Géraldine Bidau . - Nouvelle-Calédonie : CNRT/Nickel et son environnement : Nouvelle-Calédonie : IAC Edition, 2015 . - 28p. Mots-clés : télédétection Résumé : L’objectif principal du projet CoRiFor est de déterminer dans quelle mesure la fragmentation actuelle des paysages agit sur la connectivité écologique en évaluant les relations liant la composition (floristique et biologique) des peuplements forestiers avec la structure (superficie et distance inter-isolat) d’un environnement forestier fragmenté. La démarche retenue consiste à confronter 1) les composantes des peuplements au travers des espèces les plus communes et de leur capacité de dispersion avec 2) les caractéristiques structurales du paysage fragmenté mesuré sur une grande superficie par les méthodes de la télédétection. Par ailleurs, cette approche permettra d’analyser la connectivité au travers de deux échelles principales qui sont 1) le paysage ou peuplement par le biais des inventaires floristiques et de la caractérisation des paramètres structuraux et 2) le fonctionnement des organismes par le biais de la mesure et de l’estimation des capacités de dispersion et d’adaptation aux conditions écologiques Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Rapport : Appel à projet/Intermédiaire N° rapport : N°2(2014) Convention/Partenariat : CNRT/IAC/CIRAD/IRD Fonds documentaire : IAC

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1031	2015- BIR	PDF	Port Laguerre	Bureau documentation	Disponible

Caractérisation des connectivités structurelle et fonctionnelle des paysages fragmentés sur sols ultramafiques / Philippe Birnbaum 

Public ISBD Titre : Caractérisation des connectivités structurelle et fonctionnelle des paysages fragmentés sur sols ultramafiques : Projet CoRiFor Type de document : rapport Auteurs : Philippe Birnbaum ; Morgan Mangeas ; Laurent Maggia ; Thomas Ibanez ; Marc Despinoy ; P Marmey ; Vanessa Hequet ; Céline Gomez ; Géraldine Bidau ; Céline Chambrey ; Hervé Vandrot ; Elodie Blanchard Editeur : CNRT/Nickel et son environnement Année de publication : 2016 Autre Editeur : IAC Edition Importance : 86p. Mots-clés : Fragmentation  Corridor écologique  Connectivité  Conservation Résumé : L’objectif principal du projet CoRiFor est de déterminer dans quelle mesure la fragmentation actuelle des paysages agit sur les relations liant la composition (floristique et biologique) des peuplements forestiers avec la structure (superficie et distance inter-isolat) d’un environnement forestier fragmenté. Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Rapport : Appel à projet/Final Convention/Partenariat : CNRT/IAC/CIRAD-UMRamap/IRD Fonds documentaire : IAC Caractérisation des connectivités structurelle et fonctionnelle des paysages fragmentés sur sols ultramafiques : Projet CoRiFor [rapport] / Philippe Birnbaum ; Morgan Mangeas ; Laurent Maggia ; Thomas Ibanez ; Marc Despinoy ; P Marmey ; Vanessa Hequet ; Céline Gomez ; Géraldine Bidau ; Céline Chambrey ; Hervé Vandrot ; Elodie Blanchard . - Nouvelle-Calédonie : CNRT/Nickel et son environnement : Nouvelle-Calédonie : IAC Edition, 2016 . - 86p. Mots-clés : Fragmentation  Corridor écologique  Connectivité  Conservation Résumé : L’objectif principal du projet CoRiFor est de déterminer dans quelle mesure la fragmentation actuelle des paysages agit sur les relations liant la composition (floristique et biologique) des peuplements forestiers avec la structure (superficie et distance inter-isolat) d’un environnement forestier fragmenté. Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Rapport : Appel à projet/Final Convention/Partenariat : CNRT/IAC/CIRAD-UMRamap/IRD Fonds documentaire : IAC

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1299	2016-BIR-corifor	PDF	Port Laguerre	Bureau documentation	Disponible

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Cartographie et caractérisation des faciès forestiers sur sols volcano-sédimentaires en province Nord de Nouvelle-Calédonie / Philippe Birnbaum

Public ISBD Titre : Cartographie et caractérisation des faciès forestiers sur sols volcano-sédimentaires en province Nord de Nouvelle-Calédonie Type de document : rapport Auteurs : Philippe Birnbaum ; Vanessa Hequet ; Hervé Vandrot ; Thomas Ibanez ; Elodie Blanchard Editeur : IAC Edition Année de publication : 2012 Importance : 44p. Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Rapport : Convention/Intermédiaire Convention/Partenariat : AMAP/PN/IRD/IAC/CIRAD Fonds documentaire : IAC Cartographie et caractérisation des faciès forestiers sur sols volcano-sédimentaires en province Nord de Nouvelle-Calédonie [rapport] / Philippe Birnbaum ; Vanessa Hequet ; Hervé Vandrot ; Thomas Ibanez ; Elodie Blanchard . - Nouvelle-Calédonie : IAC Edition, 2012 . - 44p. Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Rapport : Convention/Intermédiaire Convention/Partenariat : AMAP/PN/IRD/IAC/CIRAD Fonds documentaire : IAC

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1022	2012-BIR	PDF	Port Laguerre	Bureau documentation	Disponible

Cartographie et caractérisation des faciès forestiers sur sols volcano-sédimentaires en Province Nord de Nouvelle-Calédonie / Philippe Birnbaum 

Public ISBD Titre : Cartographie et caractérisation des faciès forestiers sur sols volcano-sédimentaires en Province Nord de Nouvelle-Calédonie Type de document : rapport Auteurs : Philippe Birnbaum ; Vanessa Hequet ; Hervé Vandrot ; Thomas Ibanez ; Elodie Blanchard Editeur : IAC Edition Année de publication : 2013 Importance : 49p. Catégories : [Localisation]Nouvelle-Calédonie Mots-clés : cartographie  forêt  sbstrat volcano-sédimentaire  sol  nouvelle-calédonie Résumé : L'objectif est de dégager les tendances qui permettent de hiérarchiser les paramètres de la végétation en distinguant d’un côté notamment les critères relatifs à la description des peuplements (structure, composition) et de l’autre leur répartition sur le territoire, sur les différents types de sol ou selon le gradient altitudinal.(...). Le but de cette étude est de tendre vers une classification plus fine des formations végétales. Dans un premier temps, il est nécessaire de synthétiser les connaissances et de parfaire la délimitation cartographique des formations forestières qui recouvrent le substrat volcano-sédimentaire. Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Rapport : Convention/Final Convention/Partenariat : AMAP/PN/IAC/IRD/CIRAD Fonds documentaire : IAC Cartographie et caractérisation des faciès forestiers sur sols volcano-sédimentaires en Province Nord de Nouvelle-Calédonie [rapport] / Philippe Birnbaum ; Vanessa Hequet ; Hervé Vandrot ; Thomas Ibanez ; Elodie Blanchard . - Nouvelle-Calédonie : IAC Edition, 2013 . - 49p. Catégories : [Localisation]Nouvelle-Calédonie Mots-clés : cartographie  forêt  sbstrat volcano-sédimentaire  sol  nouvelle-calédonie Résumé : L'objectif est de dégager les tendances qui permettent de hiérarchiser les paramètres de la végétation en distinguant d’un côté notamment les critères relatifs à la description des peuplements (structure, composition) et de l’autre leur répartition sur le territoire, sur les différents types de sol ou selon le gradient altitudinal.(...). Le but de cette étude est de tendre vers une classification plus fine des formations végétales. Dans un premier temps, il est nécessaire de synthétiser les connaissances et de parfaire la délimitation cartographique des formations forestières qui recouvrent le substrat volcano-sédimentaire. Programme/Axe : Axe2-Diversités biologiques et fonctionnelles des écosystèmes terrestres Rapport : Convention/Final Convention/Partenariat : AMAP/PN/IAC/IRD/CIRAD Fonds documentaire : IAC

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677	2013-A- BIR	PDF	Port Laguerre	Archives	Disponible

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Community variation in wood density along a bioclimatic gradient on a hyper-diverse tropical island / Thomas Ibanez in Journal of Vegetation Science, Online (09/2016) 

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Contrasted allometries between stem diameter, crown area, and tree height in five tropical biogeographic areas / Elodie Blanchard in Trees, 30(6) (12/2016) 

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Drivers of tree species richness in New Caledonian rainforests: Beta- butnot alpha-diversity makes them exceptional / Thomas Ibanez

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Environmental correlates for tree occurrences, species distribution and richness on a high-elevation tropical island / Philippe Birnbaum in AoB Plants, 7 (07/2015) 

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Les forêts humides de la province Nord, Nouvelle-Calédonie / Philippe Birnbaum 

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On the prediction of New Caledonian rain forest structure from Pléiades images using canapy grain analysis / Elodie Blanchard 

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Prédire la structure des forêts tropicales humides calédoniennes: analyse texturale de la canopée sur des images Pléiades / Elodie Blanchard in Revue Française de Photogrammétrie et de Télédétection, 209 (2015)  

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Searching for hotspots within a hotspot : Stacked species distribution models provide new opportunities to map species richness on New Caledonia / Robin Pouteau

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Tree diversity patterns in New Caledonian forests / Philippe Birnbaum 

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Wood density facing ecological challenges in New Caledonia / Thomas Ibanez 

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